El cenote Siis Ja ha sido el epicentro de un interesante descubrimiento de la época de la Guerra de Castas del siglo XIX, donde se piensa que funcionarios del gobierno decidieron hundir este alijo de armas para evitar que los grupos mayas los utilicen contra ellos.
Se contabilizaron en el lugar aproximadamente 150 armas, muchas de ellas fusiles de fabricación inglesa y española, además de un cañón al fondo del cenote.
El equipo de investigación tomó fotografías de varios rifles, el cañón y otros objetos, a la par de documentar los diferentes daños como la caída de una escalera o vestigios de inmersiones ilegales.
