Las momias de Guanajuato junto a su museo son una de las principales actividades turísticas de la ciudad, aunque recientemente el gobierno estatal mexicano ha señalado que una de las momias presenta proliferación de una colonia de hongos.
Entre la docena de momias que viajan en la feria de exhibición por C.D de México, una de ellas presenta síntomas de poseer hongos, los cuales podrían en riesgo la salud de los visitantes, aunque no se señaló del tipo de hongos que posee.
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Este museo presenta más de cien momias presentadas en vitrinas, contándose poco más de cien ejemplares organizadas por edad, su género o la causa de muerte.
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